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厌氧菌主要分为两大类：一类是有芽孢的革兰阳性梭菌，它们韵抵抗力强，分布广泛，引起的感染有破伤风、气性坏疽、肉毒素中毒等严重疾患，并已应用类毒素与抗毒素进行特异治疗；另一类是无芽孢的革兰阳性和革兰阴性的球菌和杆菌，多系人体的正常菌群，常位于口腔、肠道、上呼吸道以及泌尿生殖道等部位，所引起的疾病属条件致病的内源性感染。
目前医院常规细菌培养方法不能检出厌氧菌感染，常用抗生素（尤其是氨基类）多无效，是某些感染性疾病迁延不愈和反复发作的重要原因之一。临床遇到以下情况时应高度怀疑厌氧菌感染，及时做厌氧菌检查：
1．感染局部产生大量气体，造成组织肿胀和坏死，皮下有捻发音。
2．发生在黏膜附近的感染，口腔、肠道、鼻咽腔、**等黏膜，均有大量厌氧菌寄生，这些部分及其附近有破损，极易发生厌氧菌感染。
3．深部外伤如枪伤后，人被动物咬伤后的继发感染，均可能是厌氧菌感染。
4．分泌物有恶臭，或为暗血红色，并在紫外光下发出红色荧光，分泌物或脓汁中有黑色或黄色硫磺样颗粒，均可能是厌氧菌感染。
5．分泌物有恶臭、呈脓性并含有坏死组织，涂片经革兰染色，镜检发现有细菌，且常规培养阴性；或在液体及半固体培养基深部长的细菌，均可能为厌氧菌感染。
6．长期应用氨基糖苷类抗生素治疗无效的病例，可能是厌氧菌感染。
7．最近有流产史者，以及胃肠手术后发生的感染。
8．常规血培养阴性的细菌性心内膜炎，并发脓毒性血栓静脉炎或伴有黄疸的菌血症等，很可能是厌氧菌感染。厌氧菌感染以颅内、胸腔、腹腔、盆腔为多见，占这些部位感染的70~93%，1/3～2/3为混合感染。
有芽孢革兰阳性杆菌——梭状芽孢杆菌属
产气荚膜梭菌(Clostridium Perfringens)
梭菌感染占厌氧菌感染的10%~20%，最常见者为产气荚膜梭菌，可致肌肉坏死（气性坏疽）、坏死性胆囊炎、败血症、流产后血管内溶血、胸膜厌氧感染等。某些型别可引起食物中毒和坏死性肠炎。在美国，多年来产气荚膜梭菌是居沙门菌、葡萄球菌之后食物中毒第三位的病原菌。产气荚膜梭菌还与抗生素相关性腹泻有关。
值得注意的事，此菌系胃肠道和皮肤的正常菌群，培养阳性结果的临床意义必须结合临床症状才能确定。
破伤风梭菌(clostridium tetani)
又称破伤风杆菌。本菌的芽孢在自然界广泛存在，患者常因刺伤或深部伤口而感染，新生儿破伤风则由脐带感染（俗称脐带风）。
它产生的毒性仅次于肉毒梭菌的外毒素，对中枢神经系统有特殊的亲和力，尤其是对脑干神经和脊髓前脚运动神经细胞，引起肌肉痉挛性收缩，表现为“角弓反张”等典型症状。
肉毒梭菌(Clostridium camis)
肉毒梭菌可产生极其强烈的外毒素——肉毒毒素，它能与胆碱能神经结合，阻断乙酰胆碱在外周神经末梢的释放．导致肌肉迟缓性麻痹。人食入毒素后，潜伏期18~72h，患者出现急性松软性瘫痪，起于面肌（包括眼皮），然后头部、咽部、唇至胸、横膈、四肢，常因呼吸衰竭而死亡。
艰难梭菌(CLostridium difficile)
本菌与假膜性肠炎、抗生素相关性肠炎有关。在自然界广泛存在，约有3%正常人的粪便中可分离出此菌，但住院患者粪便中的分离率达到13%~30%，因此认为与医院感染及抗生素的应用有关，是引起医院内成人腹泻的主要原因。临床表现可从无症状到抗生素相关性腹泻、非特异性结肠炎、假膜性结肠炎和中毒性巨结肠。对艰难梭菌相关疾病的微生物学诊断有争议。粪便培养有假阳性，明确诊断的金标准是以细胞培养来检测粪便中艰难梭菌毒素，但费时、费力，现有替代的检测肠毒素A的乳胶凝集试剂。治疗须用万古霉素或甲硝唑等。
多枝梭菌(Clostridium ramosum)
正常存在于大肠，居临床标本中梭菌的第二位，主要引起外伤所致的腹内感染，其临床重要性在于此菌耐受青霉素、克林霉素和其他抗生素。
诺维梭菌(clos-tridium novyi)和败毒梭菌(Clostridium sep-ticum)
临床常见革兰阴性无芽孢厌氧杆菌
类（拟）杆菌属(Bacteroides)
是临床标本中分离最多的革兰阴性无芽孢厌氧杆菌。类杆菌常寄生于人的口腔、肠道和女性生殖道，是一种条件致病菌，主要引起内源性感染，可见于女性生殖系统感染、脓胸、颅内感染以及菌血症等。现有18个菌种，在临床标本中以脆弱类杆菌(C.fra-gilis)最多见，约占临床厌氧菌分离株的25%，占类杆菌分离株的50%，居临床厌氧菌分离株的首位。
梭杆菌属(Fusobacterium)
存在于正常人的胃肠道、上呼吸道，可致人的严重感染，如菌血症等。其中以具核梭杆菌(F.nucleatum)最为常见，可引起厌氧性胸膜炎、吸人性肺炎、肺脓肿、脑脓肿、慢性鼻窦炎、骨髓炎、化脓性关节炎、肝脓肿以及腹腔内感染等。血液病患者或化疗过程中白细胞减少者的感染有较高的死亡率。死亡梭杆菌(F．moi-tiferum)可引起人胃肠和泌尿生殖道的软组织感染。坏死梭菌(F．necrophorum)的毒力很强，可在儿童和青年人中引起严重的感染，感染源多来自‘于咽扁桃体炎，有时并发单核细胞增多症，它是青年人扁桃体周围脓肿最常分离到的厌氧菌。
普雷沃菌属(Prevotella)
是近年来从类杆菌属中分出的一个新菌属，包括20种，最常见的是产黑色素普雷沃菌(P．ninogenica)o主要集聚于正常人体的口腔、女性生殖道等部位，组成这些部位的正常菌群，仅次子脆弱类杆菌。它是临床上较常见的一种条件致病菌，可引起这些部位的内源性感染，女性生殖道及口腔感染多见，与结缔组织的分解有关。
临床常见无芽孢革兰阳性厌氧杆菌
丙酸杆菌属(Propionitacterilim)
与临床关系密切的主要是痤疮丙酸杆菌(P．acnes)，为皮肤上的优势菌群，存在于正常皮肤的毛囊和汗腺中，与痤疮和酒渣鼻有关。在做血液、腰穿或骨髓穿刺液培养时，本菌是常见的污染菌之一。此外，痤疮丙酸杆菌在植入修复物或器械引起的感染中也起重要作用。
优（真）杆菌属(Eubacterium)
有45种，是人和动物口腔与肠道的正常菌群，对机体有营养、生物拮抗和维持肠道微生态平衡等功能。临床常见的是迟钝优杆菌(E Siraeum)、液优杆菌(Flimosum)，可与其他厌氧菌或兼性厌氧菌造成混合感染，引起心内膜炎等疾病。
双歧杆菌属(Bifidobacterium)
多达33种，是人和动物肠道的重要生理菌群，在口腔和**中也有双歧杆菌栖居，在体内起到调节和维持人体微生态平衡的重要作用。其生理学功能主要体现在：
1．含有的许多糖代谢酶，是动物和人所不具有的，这可大大提高人类和动物对某些食物的利用率。
2．具有磷蛋白磷酸酶，帮助提高蛋白消化率。
3．双歧杆菌中的二肽酶、三肽酶和羧肽酶具有血管活性功能，能发挥降血压和降血脂的效应。
4．能合成各种维生素，供宿主利用。
5．对多种细菌有拮抗作用，抑制外来细菌的生长和繁殖。
6．在肠道内通过诱导免疫反应，提高肠道浆细胞产生能力，达到防病效果。
7．通过激活吞噬细胞活性增强免疫，抑制和分解致癌剂，抑制癌基因的活化和靶向性定植肿瘤组织，并竞争营养而达到抗肿瘤作用。
乳酸杆菌属(Lactobacillus)
是消化道、**的正常共生菌，对致病菌的繁殖有抑制作用，细菌性**炎的一个重要表现就是乳酸杆菌的数量显著减少。它也广泛存在于乳制品中。乳酶生(Lactasinum)是一种活的乳酸菌制剂，在肠道中可分解糖类生成的乳酸，增加肠道酸度，从而抑制肠道病原菌的繁殖，防止蛋白质水解，可用于治疗消化不良和婴儿腹泻等。另外，乳酸菌与龋齿的形成关系密切。
厌氧球菌
消化链球菌属(Peptostreptococcus)
在临床标本分离的厌氧菌株中，厌氧消化链球菌属占20%~35%，居第二位，仅次于脆弱类杆菌。引起人体各部位组织和器官的感染，以混合感染居多，可与金黄色葡萄球菌或溶血性链球菌协同引起严重的创伤感染，即厌氧链球菌肌炎。该菌常可引起细菌性心内膜炎，很少导致菌血症。感染主要由原发病灶口腔、牙周和尿道感染引起。
消化球菌属(Peptococcus)
黑色消化球菌是该属中唯一的菌种，通常寄生在人的体表和与外界相同的腔道中，是人体正常菌群成员之一。在临床上可引起人体各部组织和器官的混合感染，常与其他细菌混合感染，如腹腔感染、肝脓肿、外阴、**及盆腔感染、肺部和胸膜感染、口腔感染、颅内感染以及皮肤和软组织感染等。
韦荣球菌届(VeiHonella)
本属有7个种，常见的是小韦荣球菌和产碱韦荣球菌，它们都是口腔、咽部、胃肠道及女性生殖道的正常菌群。大多见于混合感染，致病力不强，小韦荣球菌常见于上呼吸道感染中，而产碱韦荣球菌则多见于肠道感染。