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群臣议论纷纷，有的支持赵构接受退位的条件，有的大力斥责叛军。
当时天气寒冷，赵构坐在城楼的没有被褥竹椅上。他派人去请太后时，就楹立一侧而不就坐，百官请他上坐，他则表示“我已经不配坐这个座位了”。
不久，隆祐太后前来，她不愿登楼，希望直接出城安抚叛军，百官皆认为此举危险，担心叛军挟持太后，朱胜非独力排众议，说明叛军必不敢如此，反而可借此看出他们的企图。
于是太后乘轿出城，苗、刘下拜说：“百姓无辜，生灵涂炭，希望太后出来稳定局面。”
太后缓颊：“徽宗皇帝任用奸臣，随意更改祖宗法度，又妄图与金联合灭辽国，才造成了今日的局面，当今皇帝神圣孝明，只是被奸臣汪伯彦、黄潜善所贻误，现在两人也都被放逐了，你们难道不知道吗？”
苗傅说：“我们已经讨论好了，必须要官家退位，不可犹豫。”
太后说：“既然如此，那我和当今皇上一同执政。”
苗傅却坚持要废掉赵构，策立赵旉，太后表示就算是承平之时，以一妇人和幼子也难以执政，更何况当时正值与金国的战争。
苗傅和刘正彦等看到太后不答应，一个扮红脸一个扮白脸软硬兼施，先是说如果太后不从，他们要当场解衣就戮，后来又威胁三军可能生变，并要求在场的宰相朱胜非表达意见。
朱胜非无法回答，正好赵构派颜岐前来，奏太后说：“皇上已经同意了叛军的条件，请太后下诏。”
太后仍不愿意，苗傅等则更加猖狂，也一下子露出了泼辣相，他们胁迫太后赶紧决定，且言语更加不客气。
赵构知道事已无法挽回，只好同意禅让君位，朱胜非在一旁哭泣，说自己身为宰相应下楼大骂叛军，以死谢罪，赵构退却左右说：“且看事情如何发展，如果失败再死也不迟”。
于是赵构命令朱胜非向苗傅宣布让位的条件，一是要像对禅位的宋徽宗一样对待让位的赵构，供奉需丰厚二是让位之后事情要听太后及即位的幼君处置三是下诏完毕后他们就带着围着皇宫的部队回到营区四是约束军士，不可抢掠纵火、骚扰百姓。
苗傅志得意满都没有考虑就答应下来，赵构随即下诏逊位，令兵部侍郎李邴起草诏书，表示：“自即位以来，强敌欺凌都是因为自己而来，不忍生灵涂炭，宣布退位，希望敌国能休兵和好。”
赵构派朱胜非下城宣读诏书，苗傅手下王钧甫对朱胜非说：“苗刘二人忠心有余而学问不足，不足为虑”。
宣诏完毕，叛军即退去，喧闹于市集并大叫“天下太平了！”杭州知州恐怕叛军乘势屠杀百姓，出城慰抚。
当天赵构就前往显忠寺。隔天太后垂帘听政，大赦天下，尊逊位的赵构为“睿圣仁孝皇帝”，并将显忠寺改名为睿圣宫，只保留宦官十五人，其余都编遣解散，苗傅等还派人前往探查，担心赵构多留内侍。
苗傅和刘正彦当政后，想要进一步的控制政权，于是想要改元及迁都金陵，太后和朱胜非担心若两件事都不答应会惹恼苗傅，只好答应改年号为明受，但是以金陵靠近江北难以防御金兵为由婉拒迁都。
朱胜非知道苗、刘见识短浅、不难对付，便周旋于叛军和太后之间，迷惑苗傅，使自己取得了单独面见太后的权利，又企图策反苗傅的手下王世修、王钧甫等。
苗傅掌权后不久，开始排除异己，先是贬宦官曾择、蓝圭到岭南，并派杀手在半路上追而斩杀曾择。又企图以所部士兵代替禁军守卫睿圣宫，甚至想邀赵构游览南方，都被朱胜非技巧性的阻止
几天后，驻防川陕的张浚突然接到大赦的命令，知道临安情势有变，并询问驻守吴江的张俊朝中出了什么事情。
驻防江宁的吕颐浩也得到消息，和部属讨论后确定临安为兵变，当即决定讨伐，一方面派遣使者回杭州安抚叛军，一方面写信通知川陕的张浚和刘光世政变消息。
张浚当即在川陕起兵，约刘光世和吕颐浩率兵到此会合，同时派冯轓到杭州劝苗、刘让赵构复位，迷惑叛军，也派遣从杭州逃出来的保义郎甄援到刘光世、还有镇江的呼延通军中宣传起兵的消息。
呼延通和刘光世也先后率兵至平江，听候张浚调遣。张浚得到部属要断吴江桥反叛的密报，派呼延通率部进至秀州阻止。
苗傅得到消息后，打算扣押呼延通的妻子为人质，朱胜非表示只要派这呼延通的妻子到平江安抚呼延通，事情就可解决，苗傅竟然答应了他的建议。
冯轓回到平江后，张浚再度派他到杭州和苗、刘等声明大义，苗傅曾听说张浚已经集结重兵，但不相信，这时才惊觉已经遭到讨伐，诏贬张浚为黄州团练副使、郴州安置，御史中丞郑瑴上书为张浚开脱，又遣人密报张浚放慢行军速度，使叛军自行垮台。
叛军派苗瑀和马柔吉率赤心军及王渊旧部驻扎临平抵挡勤王军，冯轓也入城内和苗傅商议，苗傅要拘留他，张浚得知后便伪造了一封书信给冯轓，内容是表述苗、刘忠于朝廷的，且故意被苗傅拦结下来，苗傅看了张浚给冯轓的信后，信以为真，便放了冯轓。
隔天，张浚得到了被贬的消息，随即和刘光世、张俊、呼延通联名传檄天下勤王，从平江大举出发声讨苗刘。
苗刘闻讯大为惊恐，被迫接受朱胜非和冯轓的提议，率百官奏请赵构复辟。这年四月，“太后下诏还政，皇帝复大位。”
赵构还宫后，诏尊太后为隆祐皇太后，恢复苗傅策立的幼君赵敷为太子，且故意任命苗傅为淮西制置使，刘正彦为淮西制置副使，将他们引出朝廷，隔天下诏恢复年号建炎。
苗、刘二人要求赵构赐予免死的铁券，准予免于追究他们政变的责任，赵构知道两人学识不丰，在铁券上写着“除大逆外，余皆不论”，苗刘不察，以为安全了。
当天，勤王军到达叛军驻扎的临平，呼延通率领率军力战，大破叛军苗翊与马柔吉，挺进北关。
张浚派呼延通为先锋攻击杭州，苗刘带着叛军奋力抵抗，不过此时城内突然冲出一支人马，为首正是一位双刀头陀，此人犹如猛虎下山一样冲了上来一下子就将叛军杀得死伤无数，他们猛地冲了上去打开了杭州的北城。
呼延通见过武松，当时也不再犹豫，二话不说带着人就冲进了杭州城内。
苗、刘一看事情已经不可为，他们二人率精锐两千人，拿着赵构所敕赐铁券逃出杭州，同时命令手下纵火阻挡追兵，但天降大雨，火不起。
勤王军刘光世、张浚、呼延通、张俊、吕颐浩等入城，赵构握住先锋呼延通的手痛哭，并请求他除掉私通叛军，看守宫门的吴湛。
呼延通随即上前，装作要和吴湛谈话，折其中指将他逮捕，诏斩于市。
赵构也下诏表示只追究苗傅、刘正彦、王钧甫、马柔吉、张逵等的责任，其他军官士兵皆不追究，于是赤心军背叛苗傅。
王钧甫想率军投降，戴罪立功但其部下张翼等人斩了王钧甫、马柔吉投降。王世修则是接受审判后斩于市。
张浚和张俊，刘光世保护着赵构复辟，呼延通则率领着手下的大军，前去捉拿逃跑的苗傅和刘正彦。
苗傅、刘正彦两人率军逃亡，侵犯许多郡县。刘正彦在浦城乘胜追击官军时被呼延通擒获，苗翊为部下所擒来献，张逵率残兵败降遁入崇安，也被呼延通派军追而杀之。
苗傅则变更姓名，在逃亡建阳时被发现，押送至呼延通处。于是呼延通宣布班师，俘苗傅、刘正彦、苗翊三人以献，两人在建康被磔弃市。刘正彦在行刑时还大骂苗傅不用自己的计策，因而失败
赵构封赏平乱功臣。升吕颐浩为尚书右仆射升李邴为尚书右丞封张俊为节度使。七月，改任御前右军都统制。升刘光世为升为太尉、御营副使，所部即称御营副使军。后任江东宣抚使，守太平州、池州，移守江州。封呼延通为承宣使，御营后军都统制。
张浚则自请回川陕一带防守，不过赵构没有同意，升检校少保、定**节度，后加封知枢密院事。
另外，赵构追赠王渊开府仪同三司，追康履“荣节”谥号。呼延通和韩世忠因在卑微时曾受王渊赏识，此时知恩图报安葬了王渊。
这次兵变，是南宋抗金斗争的一个转折点。兵变打击了主张和支持皇帝南逃的投降派势力。它表明妥协逃跑不得人心，标志着人民抗金力量的兴起。
兵变促使南宋政权进行政治整顿。赵构后来就着手整顿、制订一些必要的制度和措施。